Минфин РФ в своем письме от 18.07.2018 N 03-11-06/2/50179 напоминает, что организации, в которых доля участия других организаций составляет более 25%, не вправе применять УСН. Это определено статьей 346.12 НК РФ.

Доля участия лица в организации определяется в виде суммы выраженных в процентах долей прямого и косвенного участия этого лица в организации.

В связи с этим автономная некоммерческая организация, единственным учредителем которой является общественная организация, не вправе применять УСН.